久久人妻熟女中文字幕av蜜芽,我我色综合,两女女百合互慰av赤裸无遮挡,脱了内裤掀起pg两边打肿

歡迎來(lái)到化學(xué)加!萃聚英才,共享化學(xué)!化學(xué)加,加您更精彩!客服熱線:400-8383-509

導(dǎo)師1人、學(xué)生1人、計(jì)算機(jī)1套,全合成Nature一篇!

來(lái)源:化學(xué)加原創(chuàng)      2025-01-03
導(dǎo)讀:近日,Scripps研究所的Ryan A. Shenvi教授課題組在天然產(chǎn)物合成過(guò)程中建立了一個(gè)虛擬庫(kù),這個(gè)庫(kù)包含了合成后期的中間體類似物,對(duì)這些類似物根據(jù)反應(yīng)性進(jìn)行分類并改變合成路線,可高效實(shí)現(xiàn)25種天然產(chǎn)物picrotoxanes的簡(jiǎn)潔合成。該方法作為人工或計(jì)算機(jī)輔助合成規(guī)劃(computer-assisted synthesis planning,CASP)的附加搜索,有望加速?gòu)?fù)雜分子的合成。文章DOI:10.1038/s41586-024-08538-y。值得一提的是,本文僅有兩位作者,1位導(dǎo)師,1位學(xué)生,導(dǎo)師是曾經(jīng)師從Phil S. Baran教授和E. J. Corey教授的Ryan A. Shenvi,學(xué)生是本科畢業(yè)于中國(guó)科學(xué)技術(shù)大學(xué)的李春雨,而且名字以中文的形式出現(xiàn)在Nature版面上。

圖片1.png


正文

Picrotoxanes類天然產(chǎn)物存在于多種植物中,大多數(shù)是γ-氨基丁酸A受體(GABAAR)的選擇性拮抗劑。其結(jié)構(gòu)主要包括三種類型:picrotoxinin(PXN),T型如tutin,C型如corianin。之前tutin,corianin和 coriamyrtin 的合成分別需要43步(0.0013%)、30步(0.27%)和至少15步(0.01%),且沒(méi)有得到類似物,無(wú)法進(jìn)行系統(tǒng)的活性研究。   歡迎下載化學(xué)加APP到手機(jī)桌面,合成化學(xué)產(chǎn)業(yè)資源聚合服務(wù)平臺(tái)。

Ryan A. Shenvi之前合成Picrotoxanes旗艦成員PXN的路線(J. Am. Chem. Soc2020142, 11376)依賴于C15甲基氧化來(lái)構(gòu)建A環(huán)內(nèi)酯。在隨后兩年多的時(shí)間里,作者對(duì)PXN合成方法進(jìn)行了多次重新設(shè)計(jì),都未能成功,這是由于B環(huán)上的微小變化會(huì)導(dǎo)致1,5-氫原子轉(zhuǎn)移(1,5-HAT)步驟更傾向于β-斷裂(圖1b)。為了避免傳統(tǒng)合成中費(fèi)力的猜測(cè)和檢查經(jīng)驗(yàn)方法,近日,作者設(shè)計(jì)了虛擬關(guān)鍵中間體庫(kù),通過(guò)計(jì)算模擬、參數(shù)化篩選,高效助力了該家族25個(gè)天然分子的全合成(圖1c)。 

圖片2.png

圖1. 觀察和研究設(shè)計(jì)

(圖片來(lái)源:Nature

Picrotoxanes的新合成路線如下:4先發(fā)生α-乙烯基化得到55發(fā)生立體選擇性Aldol反應(yīng)再脫水得到66經(jīng)分子內(nèi)Aldol環(huán)化、溴醚化和Johnson-Lemieux氧化得到醛77經(jīng)Rh-催化反應(yīng)得到三烯88可以原位分離或發(fā)生雙羥化得到9a,或經(jīng)thexylborane介導(dǎo)的硼氫化得到9b。 

實(shí)驗(yàn)中涉及的兩種反應(yīng)途徑1,5-HAT和β-裂解,使用Gaussian 16 軟件包和Scripps Garibaldi集群建模。作者在uM062X-D3功能水平上使用6-311+G(d, p)基組和SMD溶劑模型考察評(píng)估了30種同類物虛擬化合物。 

圖片3.png

圖2. 合成條目和虛擬庫(kù)

(圖片來(lái)源:Nature

超過(guò)一半的虛擬庫(kù)更傾向于β-斷裂,但有幾個(gè)成員更傾向HAT。其中,風(fēng)險(xiǎn)最高/回報(bào)最高的子目標(biāo)是雙環(huán)氧化合物10,它含有tutin本身的天然張力B環(huán)。為了從9a獲得HAT底物,首先將其立體選擇性縮醛化為亞芐基縮醛(圖3),Pt/C催化氫化原位進(jìn)行,得到15單一非對(duì)映異構(gòu)體,而9a的氫化得到1.7:1的 dr。酯用LDA拔氫,在-60 °C下進(jìn)行γ-選擇性氧化,然后DIBAL還原,得到1616甲磺酰化,然后進(jìn)行分子內(nèi)烯丙基取代,得到單環(huán)氧化物1717轉(zhuǎn)化為18,接著進(jìn)行Suárez 1,5-HAT。1,5-HAT醚化產(chǎn)物19為主要產(chǎn)物,產(chǎn)率為83-96%。醚氧化成橋接內(nèi)酯20,然后用Zn0進(jìn)行β-溴醚還原裂解,再用SmI2和水進(jìn)行苯甲酸酯脫保護(hù),12-18步內(nèi)得到(+)-tutin (1),總產(chǎn)率為8.4-20.3%。 

圖片4.png

圖3. 使用計(jì)算的中間體合成三種picrotoxanes 

(圖片來(lái)源:Nature

甲磺酸酯21經(jīng)還原可得到(+)-corianin (2),而甲磺酸酯21本身可通過(guò)酯還原、環(huán)氧化、甲磺酰化從15獲得,總之,以13-20步,總產(chǎn)率為3.6-6.9%可合成(+)-2作者還測(cè)試了碘代環(huán)氧物129b衍生得到烯丙醇24,Suárez條件下,烯丙醇得到環(huán)氧非對(duì)映體混合物,以>20:1的比例進(jìn)行1,5-HAT而不是β-斷裂。碘化物25在用DMDO處理后消除,得到不穩(wěn)定的環(huán)氧烯烴,用高氯酸水溶液水合提供26。與(+)-tutin (1)的合成類似,可以總步驟13-17步,總產(chǎn)率2.6-3.6%得到 (+)-coriamyrtin (13)。

圖片5.png

圖4. 參數(shù)化和預(yù)測(cè)

(圖片來(lái)源:Nature

成功預(yù)測(cè)庫(kù)成員的選擇性需要很高的計(jì)算成本,作者搜索了可以準(zhǔn)確預(yù)測(cè)HAT與β-斷裂相對(duì)速率的參數(shù),而無(wú)需計(jì)算過(guò)渡態(tài)或產(chǎn)物。分析發(fā)現(xiàn),B環(huán)對(duì)A環(huán)二面角ψ和φ的影響決定了1,5-HAT和β-斷裂的選擇性(圖4c)。較小的φ值使O3靠近C15,加速1,5-HAT;ψ和φ組合影響NBO電荷,電荷越大,HAT越快。結(jié)果發(fā)現(xiàn),ψ=–70°和φ=–30°最有利于1,5-HAT。  

圖片6.png

圖5. 通過(guò)虛擬庫(kù)選擇輔助導(dǎo)航化學(xué)空間
(圖片來(lái)源:Nature

總結(jié)

Scripps研究所的Ryan A. Shenvi教授課題組建立了一個(gè)虛擬庫(kù),其中包含后期中間體類似物,對(duì)這些類似物根據(jù)反應(yīng)性進(jìn)行分類并改變了合成途徑,可高效實(shí)現(xiàn)25種picrotoxanes的簡(jiǎn)潔合成。 

在計(jì)算機(jī)輔助合成規(guī)劃(CASP)中,關(guān)注個(gè)別反應(yīng)的可行性代表了特異性與覆蓋率或分辨率與速度之間的權(quán)衡,這對(duì)于復(fù)雜分子來(lái)說(shuō)是有意義的,因?yàn)槁襟E是合成而不是設(shè)計(jì)。預(yù)先探索關(guān)鍵中間體類似物將任何合成的主要活動(dòng)提前到設(shè)計(jì)階段,這雖然延長(zhǎng)了設(shè)計(jì)時(shí)間,但總體上節(jié)省了時(shí)間。這種方法在基于轉(zhuǎn)化的策略受到限制時(shí)最為合理,該策略通過(guò)識(shí)別一個(gè)或多個(gè)關(guān)鍵中間體來(lái)應(yīng)對(duì)EXTGT樹(shù)的指數(shù)“一變多”問(wèn)題。隨著計(jì)算能力和軟件的進(jìn)步,“準(zhǔn)確預(yù)測(cè)反應(yīng)結(jié)果”這一目標(biāo)變得可以實(shí)現(xiàn),并導(dǎo)致了本文描述的虛擬庫(kù)搜索,并簡(jiǎn)潔合成了25種picrotoxanes。本文的目標(biāo)是探索這些化學(xué)類型作為選擇性離子通道抑制劑,本文的許多同系物缺乏不穩(wěn)定的C11內(nèi)酯,可能證明是擾亂GABA能信號(hào)傳導(dǎo)的有用線索。這些簡(jiǎn)潔的合成使得徹底探索picrotoxane化學(xué)空間成為可能。

本文的解決方案涉及一個(gè)單獨(dú)的預(yù)測(cè)模塊,用于數(shù)據(jù)庫(kù)表示較少的步驟:只需5個(gè)實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)點(diǎn)即可進(jìn)行準(zhǔn)確的DFT基準(zhǔn)測(cè)試。這種方法不僅有效,還反映了多步合成活動(dòng)的現(xiàn)實(shí)情況,通常探索(非虛擬)類似物庫(kù)以達(dá)成最終的目標(biāo)生成模板(TGT)。

文獻(xiàn)詳情:

Total synthesis of twenty-five picrotoxanes by virtual library selection. 
Chunyu Li (李春雨) & Ryan A. Shenvi*. 
Nature2024
https://doi.org/10.1038/s41586-024-08538-y

image.png

長(zhǎng)按掃碼,查看原文


聲明:化學(xué)加刊發(fā)或者轉(zhuǎn)載此文只是出于傳遞、分享更多信息之目的,并不意味認(rèn)同其觀點(diǎn)或證實(shí)其描述。若有來(lái)源標(biāo)注錯(cuò)誤或侵犯了您的合法權(quán)益,請(qǐng)作者持權(quán)屬證明與本網(wǎng)聯(lián)系,我們將及時(shí)更正、刪除,謝謝。 電話:18676881059,郵箱:gongjian@huaxuejia.cn

主站蜘蛛池模板: 嘉义县| 长丰县| 屏南县| 富阳市| 峨山| 静安区| 都安| 肇源县| 柳江县| 合作市| 黔东| 新巴尔虎右旗| 凤山县| 施甸县| 桐庐县| 崇文区| 游戏| 尼勒克县| 明星| 时尚| 广元市| 犍为县| 铜陵市| 黑山县| 林西县| 精河县| 肥西县| 屯门区| 新郑市| 嘉兴市| 昌平区| 临湘市| 盐城市| 思茅市| 漯河市| 乌兰浩特市| 康保县| 万盛区| 永修县| 彰化市| 胶南市|